Η υγεία των ζώων, οι συνθήκες διαβίωσής τους καθώς και οι συνθήκες υγιεινής που επικρατούν στα σφαγεία, στα εργοστάσια επεξεργασίας και τυποποίησης κρεάτων είναι το τρίπτυχο των εργασιών του κτηνίατρου. Πιο συγκεκριμένα, εξετάζει τα ζώα (εκτροφής και κατοικίδια) σε περίπτωση που διαγνώσει κάποια ασθένεια τους χορηγεί την κατάλληλη θεραπευτική αγωγή ή προβαίνει σε προληπτικό εμβολιασμό για να προστατεύσει τη δημόσια υγεία από μολυσματικές ασθένειες (φυματίωση, εχινοκοκκίαση, γρίπη των πτηνών, λύσσα κ.ά.) που μεταδίδονται από τα ζώα και στον άνθρωπο. Επίσης ελέγχει τους χώρους που διαβίουν τα ζώα και συμβουλεύει τους ιδιοκτήτες τους ή τους εκτροφείς, για θέματα που αφορούν την υγιεινή, τη διατροφή και την αναπαραγωγή τους. Ακόμη εξετάζει τα σφάγια πριν διατεθεί το κρέας στο κοινό, πραγματοποιώντας συχνά αιφνίδιους και αυστηρούς ελέγχους στους χώρους συντήρησης, έκθεσης και πώλησης των κρεάτων. Επιπλέον είναι υπεύθυνος και ελέγχει τη διαδικασία επεξεργασίας, συσκευασίας και προώθησης των προϊόντων κρέατος στην αγορά, φροντίζοντας να πληρούν τις προδιαγραφές και τους κανόνες υγιεινής που προβλέπονται από τη σχετική νομοθεσία.